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Amanite tue-mouches dans une pessière, sur un sol moussu : un partenaire ectomycorhizien chez lui

Mycorhizes

Mycorhizes : quelle plante avec quel champignon ?

Presque toutes les plantes de la Terre partagent leurs racines avec un champignon. Il explore un sol que la plante n'atteint pas seule, lui apporte du phosphore et de l'eau, tient à distance les maladies racinaires, et il est payé en sucre. Ce partenariat a plus de 400 millions d'années : il est plus ancien que la racine elle-même.1,2 Seulement, tous les champignons ne vont pas avec toutes les plantes. Qui sait quel système possède une espèce plante ses arbres et arbustes autrement, et comprend aussi pourquoi les cèpes poussent sous le chêne et jamais sous le pommier. Cette page commence tout au début : qu'est-ce qu'un champignon, de quoi vit-il, que veut dire « mycorhize », puis entre peu à peu dans le détail.

~85 %des espèces de plantes vasculaires vivent durablement avec un champignon partenaire3
4 modes de viemycorhize, endophyte, décomposeur, pathogène : un seul d'entre eux est un échange
400 millionsd'années : le partenariat est plus ancien que les racines, les feuilles et les graines
4 typesde mycorhizes existent, et deux d'entre eux se partagent presque tout le monde végétal

Du général au détail

D'abord, mettre de l'ordre : champignon, mode de vie, mycorhize

Avant de parler de types et de partenaires, il faut distinguer trois niveaux, sinon tout semblera contradictoire par la suite. Ouvre ce qui t'intéresse ; si tu connais déjà le sujet, passe directement à la suite.

Au fond, qu'est-ce qu'un champignon ?

Demande à un enfant de dessiner un champignon, il dessinera un parapluie. Mais ce n'est qu'une forme possible de sporophore (la partie visible), et beaucoup de champignons n'en forment aucun.

Un adulte essaierait d'être plus précis : un être vivant qui se nourrit par des filaments plutôt que par des racines, qui ne fait pas de photosynthèse et qui se reproduit par des spores plutôt que par des graines. Cela paraît raisonnable. Sauf qu'aucun des trois critères ne tient :

  • Des filaments plutôt que des racines ? Les levures sont des champignons unicellulaires, sans aucun filament. Et à l'inverse, certaines bactéries forment un mycélium et sentent même le sous-bois.4 (Là où il y a des filaments, un filament isolé s'appelle une hyphe et leur réseau le mycélium : nous aurons besoin de ces deux mots tout de suite.)
  • Pas de photosynthèse ? Le monotrope sucepin n'en fait pas non plus. C'est cette plante blanc jaunâtre qui sort du sol dans les forêts de conifères et ressemble elle-même à un champignon. C'est pourtant une plante.
  • Des spores plutôt que des graines ? Les fougères font exactement pareil.

Ce qui reste, c'est la paroi cellulaire.5

Chaque cellule de champignon est entourée d'une enveloppe rigide qui contient de la chitine (C8H13NO5)n. Les plantes construisent leurs enveloppes en cellulose (C6H10O5)n. Chimiquement, c'est presque la même molécule ; simplement, dans la chitine, chaque maillon porte en plus un groupe azoté. Les animaux n'ont pas de paroi cellulaire du tout ; un coléoptère porte bien de la chitine, mais comme carapace à l'extérieur du corps et non comme enveloppe autour de chaque cellule. Et les bactéries utilisent encore autre chose : la muréine.

En bref : les champignons sont des êtres à chitine, les plantes des êtres à cellulose.

La contre-épreuve : le mildiou.

Il forme des filaments, digère à l'extérieur de son corps et vit en tout point comme un champignon. Sauf qu'il n'en est pas un. Il fait partie des oomycètes, il est plus proche parent des algues brunes, et sa paroi cellulaire est faite de cellulose : un être à cellulose qui joue au champignon.6 Ce n'est pas un détail académique : les produits contre les vrais champignons sont souvent sans effet sur lui.

À l'œil nu, impossible de le deviner. Autrefois, on classait selon l'aspect et la reproduction, et c'est précisément pour cela que des organismes qui n'en sont pas sont restés des décennies parmi les champignons. Seule la comparaison des génomes a remis les choses en place.

Tout n'est pas ce qu'il paraît. Les dauphins non plus ne sont pas des poissons, mais des mammifères.

Et maintenant, le point qui nous occupe ici.

Un champignon ne peut pas fabriquer de sucre et doit le prendre à l'extérieur. Là encore, comme on vient de le voir, ce n'est pas une particularité : les animaux n'en sont pas capables non plus, et le monotrope sucepin non plus. Pour cette page, une seule question compte : où un champignon va-t-il chercher son sucre ?

Car c'est justement de là que viennent les récits sur le Wood Wide Web. Procédons dans l'ordre.

De quoi vivent les champignons ? Les quatre modes de vie

Tout dépend de la provenance du sucre. On en déduit quatre modes de vie, classés selon ce que le champignon colonise et selon qu'il paie ou non :

GroupeVit sur ou dansRôle au jardin
Champignons mycorhiziensdes racines vivantes, et paie pour celaApprovisionnement. Tu en veux. Cèpe, girolle, truffe, amanite tue-mouches.
Endophytesdes tissus vivants, sans échangeTolérance au stress. Un bonus : ils sont là de toute façon. On ne les voit jamais.
Pathogènesdes tissus vivants, à leurs dépensMaladie. Tu n'en veux pas. Armillaire, Phytophthora, moniliose, tavelure.
Saprotrophesde la matière morteDécomposition et humus. Tu en as besoin. Pleurote, shiitake, champignon de Paris.

Les saprotrophes ne sont pas des nuisibles : c'est la confusion la plus fréquente. Ils décomposent les feuilles, le paillage, les déchets de taille et le bois mort, et sont ainsi à la base de toute formation d'humus. Sans eux, le paillage reste simplement là et ne devient rien. La pourriture blanche et la pourriture brune ne sont d'ailleurs que leurs deux façons de travailler le bois, et elles se déroulent normalement sur du bois mort : dans le tas de bois mort, dans la souche, dans la butte autofertile. Comme ils n'ont pas besoin de partenaire vivant, ce sont justement ces champignons-là que l'on peut cultiver.

Là où la frontière est vraiment floue : entre endophyte et pathogène. Le même champignon reste des années inoffensif dans les tissus et devient agressif dès que la plante est stressée. C'est un mécanisme réel, expliqué juste dans la section suivante. Et le fait que l'armillaire continue de décomposer le bois après avoir tué l'arbre n'en fait pas un décomposeur : il sait faire les deux, mais il a commencé comme pathogène.

Les endophytes : la majorité invisible dans chaque feuille

Ils sont partout : dans les feuilles, les aiguilles, l'écorce, le bois, et oui, aussi dans les racines. Pratiquement chaque plante abrite des endophytes, souvent des dizaines d'espèces (y compris le pommier dont tu cueilles les fruits).7 On ne les voit pas, car ils ne forment pas de sporophore tant que le tissu est vivant ; ils se logent sous forme de fines hyphes entre les cellules végétales.

De quoi ils vivent : de ce qui traîne de toute façon entre les cellules, des sucres et des acides aminés qui suintent à travers les parois. Très peu, noyé dans le bruit de fond. C'est pourquoi la plante ne s'en aperçoit pas. Toute la différence avec la mycorhize est là : celle-ci reçoit de grandes quantités de sucre, mais par un véritable organe et en échange d'une contrepartie. L'endophyte, lui, ne fait que se servir au passage.

Ce qu'ils font (trois choses qui comptent au jardin) :

  • Ils occupent la place. Là où un endophyte est installé, aucun pathogène ne peut plus s'installer.
  • Ils produisent des substances de défense contre les insectes ravageurs et les maladies fongiques.8
  • Ils entraînent les défenses de la plante, qui réagit ainsi plus vite aux vraies attaques.

On s'en sert même : les graminées fourragères porteuses d'endophytes sont plus résistantes, et deviennent toxiques pour le bétail.9 C'est le cas le plus connu de cette double nature.

La question du stress. Ce n'est pas l'endophyte qui s'en prend à l'arbre. En réalité, beaucoup de ces champignons sont des pathogènes opportunistes. Tant que l'arbre est vigoureux, ses défenses les tiennent en échec et ils restent inoffensifs. Quand la sécheresse fait tomber ces défenses, ils changent de stratégie et se mettent à croître. Voilà pourquoi, les années de sécheresse, des branches dépérissent soudain sans qu'aucune maladie ne soit « arrivée » : le pathogène était là depuis des années. Diplodia sur les pins et Botryosphaeria sur les arbres fruitiers fonctionnent exactement ainsi.10

Et encore une chose, qui boucle la boucle : quand la feuille tombe, beaucoup de ces champignons sont les premiers à entamer la décomposition, puisqu'ils sont déjà à l'intérieur et peuvent démarrer aussitôt. Cela n'en fait pas des décomposeurs ; endophyte est un mode de vie à part entière. Cela signifie seulement que, sur une feuille fraîchement tombée, personne n'a besoin d'arriver de l'extérieur.11

Les pathogènes, ce ne sont pas des bactéries ? Qui rend vraiment les plantes malades

Les bactéries ne sont qu'un groupe parmi d'autres, et chez les arbres et arbustes, le plus petit :

  • Les champignons : chez les arbres, de loin la plus grande part. Armillaire, moniliose, tavelure, oïdium, rouilles, fomès des racines.
  • Les oomycètes : ils ressemblent à des champignons et vivent comme des champignons, mais n'en sont pas ; ils sont plus proches des algues brunes. Parmi eux, Phytophthora, responsable de nombreuses pourritures des racines et du collet et du mildiou de la pomme de terre. Pour la lutte, ce n'est pas un détail académique : les produits contre les vrais champignons sont souvent sans effet sur eux.
  • Les bactéries : par exemple le feu bactérien, redouté en arboriculture fruitière, mais c'est l'exception.
  • Les virus : transmis le plus souvent par les pucerons ou les outils de taille, incurables.
  • Les nématodes : des animaux, pas des microbes, et souvent sous-estimés dans le sol.

Et la distinction la plus utile au jardin : un champignon sur du bois mort n'est pas un pathogène. Ce qui pousse dans le tas de bois mort, sur la souche ou dans la butte autofertile décompose ; il n'attaque rien. C'est seulement quand des sporophores apparaissent sur un tronc vivant qu'un second coup d'œil s'impose.

Pour un arbre, cela veut dire : quand on parle de maladie, on parle dans l'immense majorité des cas d'un champignon. Et quand on entend parler d'un champignon géant en forêt, il ne s'agit pas forcément d'un partenaire : le champignon recordman est un tueur d'arbres. On en reparle plus bas.

Alors, que veut dire « mycorhize » ?

Littéralement « racine-champignon », du grec mykês, champignon, et rhiza, racine. Et l'essentiel est déjà dit :

La mycorhize n'est ni une espèce ni un groupe de champignons, c'est une association. On désigne par là l'organe commun formé par le champignon et la racine vivante, pas le champignon seul. On ne peut ni l'acheter ni la prendre dans la main ; elle n'apparaît que là où les deux partenaires se rencontrent.

Trois caractéristiques la définissent : un contact étroit et régulé entre le champignon et la racine vivante ; un échange dont les deux parties tirent profit ; et une structure fixe au point de contact, reconnaissable au microscope.

Un champignon capable de former une telle association s'appelle un champignon mycorhizien. En règle générale, il n'entretient pas une seule association de ce genre, mais beaucoup en même temps, avec plusieurs racines et souvent aussi avec plusieurs plantes.

Pourquoi certains types apparaissent-ils deux fois plus loin ? Trois niveaux à bien distinguer

C'est l'endroit où presque tout le monde s'emmêle, d'où cette mise au point avant d'arriver aux types :

  • Niveau 1, le mode de vie du champignon : mycorhizien, endophyte, saprotrophe, pathogène. Quatre en tout, voir plus haut.
  • Niveau 2, le type d'association, à l'intérieur du mode de vie « mycorhizien » : arbusculaire, ecto, éricoïde, orchidoïde. Chaque type a son propre groupe de champignons, et ces groupes ne sont pas interchangeables.
  • Niveau 3, les variantes à l'intérieur d'un type. C'est là que se rangent l'arbutoïde et la monotropoïde : elles sont formées par les mêmes champignons ectomycorhiziens que l'ectomycorhize ordinaire, mais sur d'autres plantes, et elles sont donc construites autrement.

Le point décisif : la variante qui se forme dépend de la plante, pas du champignon. Un seul et même champignon ectomycorhizien forme une ectomycorhize ordinaire avec un pin, une mycorhize arbutoïde avec un arbousier et une mycorhize monotropoïde avec un monotrope sucepin : un individu fongique, trois variantes.12,13

En image : les câbles de recharge.

  • Niveau 2, les types, ce sont différentes familles de connecteurs : USB et Lightning. Un pommier a l'une des prises, un chêne l'autre ; un champignon avec la mauvaise fiche ne peut tout simplement pas se brancher, aussi près soit-il. La myrtille et l'orchidée ont encore chacune leur propre connecteur.
  • Niveau 3, les variantes, ce sont des formes de fiche à l'intérieur d'une famille : USB-A, USB-C, Micro-USB. Tout est de l'USB, ce sont toujours les mêmes champignons ; seule la prise a un aspect différent chez le pin, l'arbousier et le monotrope sucepin.
  • Le saule et le peuplier sont les appareils dotés de deux prises différentes, et peuvent donc faire le lien entre deux familles.
  • Le monotrope sucepin est l'appareil qui ne fait que se recharger et ne rend jamais rien.

Là où l'image cesse de fonctionner : une fiche est une question d'ajustement, une mycorhize est un échange. Et la prise n'existe pas d'avance : le champignon et la racine la construisent ensemble, à chaque fois de nouveau.

Quand cette page parle des « deux systèmes », il s'agit des deux grandes familles : arbusculaire et ecto. C'est la distinction qui compte au moment de planter.

Tous les champignons sont-ils mycorhiziens ?

Non, au contraire : c'est une minorité. L'immense majorité des champignons sont des décomposeurs. Seuls certains groupes savent former des mycorhizes, et ceux qui le savent en dépendent le plus souvent.

On peut d'ailleurs le constater au supermarché : on y trouve du champignon de Paris, des pleurotes et du shiitake, mais ni cèpes ni girolles cultivés. Les premiers sont des décomposeurs et poussent sur de la paille, du fumier ou du bois. Les seconds ont besoin d'un arbre vivant et ne peuvent donc pas être cultivés en hangar : on ne peut que les cueillir, ou planter un arbre dont les racines ont été inoculées au préalable. C'est exactement ce que l'on fait avec les truffes.

Inversement, cela veut aussi dire qu'un champignon qui pousse dans le compost n'est pas un partenaire pour ton arbre. Et qu'un champignon mycorhizien ne peut pas vivre sur du compost.

Les mots qui reviennent sans cesse sur cette page
Hyphe
Un filament de champignon isolé, vingt à cinquante fois plus fin qu'une radicelle.
Mycélium
Le réseau formé par de nombreuses hyphes : le champignon proprement dit.
Sporophore
Ce que l'on cueille et que l'on mange. Seulement l'organe qui produit les spores, pas l'être vivant.
Spore
L'unité de dispersion du champignon : unicellulaire, fine comme de la poussière, dispersée par le vent. C'est ainsi qu'un champignon arrive sur un nouveau terrain. Les fougères, les mousses et les bactéries ont aussi des spores ; pour les champignons, ce n'est donc rien de particulier.
Rhizomorphe
Un cordon formé d'hyphes regroupées en faisceau. Certains champignons (surtout l'armillaire) s'en servent pour franchir des distances sans racines.
Symbiote
Partenaire d'une vie commune dont les deux parties tirent profit.
Saprotrophe
Décomposeur : vit de matière morte.
Endophyte
Vit dans les tissus végétaux vivants sans que la plante s'en aperçoive.
Pathogène
Agent de maladie.
Myco-hétérotrophe
Plante qui se nourrit entièrement ou en partie du champignon plutôt que de la photosynthèse.
Genet
Un individu fongique : tout ce qui est issu d'une même spore, quelle que soit son étendue.

Les bases

Ce qu'apporte vraiment un champignon partenaire

Une radicelle mesure environ un demi-millimètre d'épaisseur. Un filament de champignon est vingt à cinquante fois plus fin et passe donc dans des pores du sol qui restent fermés à la racine. Un gramme de sol contient souvent des dizaines de mètres de filaments fongiques.14,15 La plante multiplie ainsi la surface par laquelle elle absorbe, sans former elle-même un seul millimètre de racine.

Quatre services se cachent derrière :

🧪

Phosphore

Le point le plus important. Le phosphore est le plus souvent abondant dans le sol, mais fortement fixé et presque immobile. Autour d'une racine, il est épuisé en peu de temps, et la plante n'atteint pas le reste. Le champignon va le chercher dans des zones situées bien au-delà.15

💧

Eau et tolérance à la sécheresse

Cette même portée vaut pour l'eau. Les plantes colonisées traversent souvent mieux les périodes sèches16 ; sur les sols filtrants, c'est souvent la différence entre une plante qui s'enracine et une plante qui végète.

🛡️

Protection contre les maladies racinaires

Le manteau fongique occupe la surface de la racine et la rend inaccessible aux champignons pathogènes ; s'y ajoutent des substances de défense et une vigilance accrue des défenses de la plante.17,18 Les agrumes sont réputés particulièrement dépendants de leur champignon partenaire.19

🔗

Échanges avec les voisins

Tout ce qui est relié au même champignon est connecté. Il est prouvé que du carbone, de l'azote et du phosphore passent ainsi d'une plante à l'autre ; combien et jusqu'où, c'est là-dessus que porte le débat. On en reparle plus bas.

Les formes

Les quatre types de mycorhizes (et les deux qui couvrent presque tout)

Passons au deuxième niveau : à l'intérieur du mode de vie « mycorhizien », il existe quatre types. Ils se distinguent par l'étroitesse du lien entre champignon et racine : le champignon pénètre-t-il dans la cellule racinaire ou se contente-t-il de l'envelopper ? En pratique, il suffit de bien distinguer les deux premiers ; les deux autres concernent les myrtilles et les orchidées. Si les niveaux ne sont pas encore clairs, relis plus haut.

FormeQuiCe qui la caractérise
Mycorhize arbusculaireEnviron 72 % de toutes les espèces de plantes vasculaires : presque tous les fruits, légumes, aromatiques, graminées, palmiers et légumineuses, et la quasi-totalité des arbres utiles tropicauxLe champignon pénètre dans la cellule racinaire et y forme des organes d'échange ramifiés en petits arbres, les arbuscules. Il ne forme pas de sporophores visibles : on ne le voit jamais. Seules quelques centaines d'espèces de champignons desservent cet immense groupe de plantes (244 étaient décrites en 2015, les analyses ADN laissent penser qu'il y en a de 300 à 1 600)20, et elles sont donc peu exigeantes.
EctomycorhizeEnviron 2 % des espèces, mais ce sont les arbres qui dominent les forêts des zones tempérée et boréale, plus quelques familles tropicalesLe champignon enveloppe l'extrémité de la racine d'un manteau et ne pénètre pas dans les cellules. Environ 20 000 espèces de champignons20, dont beaucoup sont liées à quelques essences seulement, et presque tous les champignons comestibles connus en font partie : cèpe, girolle, truffe, bolet bai.
Mycorhize éricoïdeÉricacées : myrtille, airelle rouge, canneberge, rhododendron, bruyèreSpécialisée dans les sols acides, humides et riches en humus. Le champignon libère l'azote directement à partir de l'humus brut non décomposé : c'est pourquoi les myrtilles poussent là où les autres plantes ne trouvent rien.21
Mycorhize des orchidéesToutes les orchidées, environ 10 % de toutes les espèces de plantes vasculairesLa graine d'une orchidée est fine comme de la poussière et n'a pas de réserves. Sans le champignon adéquat pour la nourrir pendant la germination, elle ne lève pas. C'est pourquoi on ne peut pas simplement semer des orchidées.22

Deux variantes, et pourquoi ce ne sont pas des types à part

Les livres citent souvent deux types supplémentaires. Mais ce n'en sont pas : les deux sont formés par des champignons ectomycorhiziens tout à fait ordinaires et vont donc dans le même tiroir que la deuxième ligne.

Mycorhize arbutoïde : arbousier et busserole (raisin d'ours). Un manteau comme dans l'ectomycorhize, mais le champignon pénètre en plus dans la cellule.

Mycorhize monotropoïde : monotrope sucepin et apparentés, des plantes sans chlorophylle. Un seul et même individu fongique est relié d'un côté à un épicéa et de l'autre au monotrope sucepin, qui vit entièrement du sucre de l'arbre.13,23 La meilleure preuve que le carbone passe d'une plante à l'autre par un champignon.

En bref : la variante qui se forme dépend de la plante, pas du champignon. Dans l'image de tout à l'heure, ce sont USB-A, USB-C et Micro-USB, mais tout est de l'USB. Un même individu fongique peut desservir en même temps un pin, un arbousier et un monotrope sucepin. Quand cette page parle des « deux systèmes », il s'agit des deux grandes familles de connecteurs : arbusculaire et ecto, et ces deux variantes comptent parmi les ecto.

Deux choses n'ont pas leur place dans cette liste, même si on les y trouve souvent : les endophytes septés foncés, des champignons qui vivent dans les racines sans former aucune des formes classiques ; très répandus sur les milieux extrêmes, leur effet reste mal connu, mais ce sont des endophytes et non des mycorhizes. Et les plantes totalement dépourvues de champignon partenaire, environ huit pour cent des espèces : une section leur est consacrée juste après.

Tour du monde

Quelle plante a quelle mycorhize ? Du pommier au cocotier

La règle empirique vaut sur tous les continents : l'arbusculaire est la norme, l'ectomycorhize l'exception.3,24 Seulement, cette exception se concentre sur quelques familles, et ce sont justement elles qui forment les grandes forêts de l'hémisphère Nord, de l'Australie et de l'Asie du Sud-Est.

Espèce ou groupeSystèmeRemarque
Pommier, poirier, cognassier, cerisier, prunier, pêcher, amandierarbusculaireTous les fruits à pépins et à noyau, plus le fraisier, le framboisier, la ronce, le groseillier et le groseillier à maquereau.
NoyerarbusculaireSouvent confondu : malgré sa taille, le noyer n'est pas un arbre ectomycorhizien. Son plus proche parent, le pacanier, l'est en revanche.25,26
Noisetier, chêne, hêtre, bouleau, châtaignier, charme, pacanierectoLes arbres à champignons comestibles. Sous le noisetier et le chêne poussent les truffes, sous le bouleau le bolet rude, sous l'épicéa et le pin le cèpe et le bolet bai.
Pin, épicéa, mélèze, sapin, douglas, cèdreectoLes conifères sont presque sans exception des partenaires ectomycorhiziens. Sans colonisation, les semis de pin ne poussent pratiquement pas sur un sol brut.
AulneectoDoublement équipé : l'ectomycorhize pour le phosphore, plus des nodosités à Frankia pour l'azote de l'air. C'est pourquoi il s'en sort sur des sols bruts où rien d'autre ne s'installe.
Olivier de Bohême, argousierarbusculaireEux aussi portent des nodosités à Frankia, mais avec l'autre système fongique que l'aulne27 : une différence facile à oublier quand on compose un groupe.
Saule, peuplierles deuxL'exception la plus importante de toutes. Ils peuvent former côte à côte une mycorhize arbusculaire et une ectomycorhize, et ainsi faire le lien entre deux groupes. Le plus souvent, l'ectomycorhize domine ; l'arbusculaire s'y ajoute surtout chez les jeunes plants et sur les sols humides.3,28
Eucalyptus, de nombreux acaciasecto (acacias : arbusculaire selon l'espèce, parfois aussi ecto)L'Australie est le grand continent de l'ectomycorhize en dehors du Nord.
Manguier, avocatier, papayer, bananier, agrumes, caféier, cacaoyer, olivier, figuier, palmier dattier et cocotierarbusculairePratiquement toutes les cultures tropicales et subtropicales, sans exception. Les agrumes sont réputés particulièrement dépendants, surtout sur des porte-greffes à racines grossières.19,29
Maïs, blé, millet, riz, pomme de terre, tomate, oignon, poireau, carotte, courge, haricot, pois, trèfle, luzernearbusculairePresque toutes les grandes cultures et le maraîchage. Le poireau et l'oignon sont réputés très fortement colonisés et servent souvent de plantes indicatrices dans les essais.
Myrtille, airelle rouge, canneberge, rhododendronéricoïdeSystème à part, champignons à part. Une planche de myrtilles ne profite guère d'un voisin ectomycorhizien et pas du tout d'un voisin arbusculaire. L'exception connue : quelques champignons du groupe de Rhizoscyphus ericae colonisent à la fois la bruyère et le pin, mais seulement sur quelques centimètres. Il n'en résulte pas de grand réseau commun.30,31
Chou, colza, moutarde, radis, roquette, cresson, raifortaucuneToutes les crucifères. Ce que cela signifie en pratique.
Betterave rouge, blette, épinard, quinoa, amaranteaucuneChénopodiacées et amaranthacées.
Rhubarbe, oseille, sarrasin, renouéeaucunePolygonacées, le plus souvent sans colonisation ou faiblement colonisées.
LupinaucuneForme à la place des touffes de racines serrées qui dissolvent elles-mêmes le phosphore du sol à l'aide d'acides32 : une solution à lui pour le même problème.
Racine colonisée : mycélium blanc sur les radicelles, à côté une extrémité racinaire ectomycorhizienne gainée et une image au microscope colorée montrant des arbuscules dans le tissu racinaire
La même racine, agrandie deux fois : en haut à droite l'ectomycorhize, où le champignon pose un manteau autour de l'extrémité de la racine. En bas à droite la forme arbusculaire : ici, il pénètre dans la cellule et y forme les fines ramifications qui lui ont donné son nom.

Les exceptions

Les plantes sans champignon partenaire, et pourquoi c'est important au jardin

Environ huit pour cent des plantes vasculaires se passent totalement de mycorhizes, et sept pour cent de plus sont tantôt colonisées, tantôt non.3,33,34 Elles ont abandonné le partenariat au cours de l'évolution et se procurent le phosphore elles-mêmes : avec des acides qui le libèrent de ses liaisons, et avec des touffes de racines remarquablement denses. Cela fonctionne, mais coûte plus d'énergie à la plante ; c'est pourquoi ces espèces sont typiquement chez elles sur des milieux perturbés et riches en nutriments.

Et justement, le potager en est plein : le chou sous toutes ses formes, le radis, le radis noir, la moutarde, la roquette, le cresson, le raifort. S'y ajoutent la betterave rouge, la blette, l'épinard, la rhubarbe et la plupart des lupins.

Le piège de l'engrais vert

Il en découle un point pratique que l'on lit rarement : la moutarde et le radis fourrager en interculture ne nourrissent pas les champignons. Là où ne poussent que des crucifères pendant un an, le nombre de champignons arbusculaires dans le sol diminue nettement, faute d'hôte : dans un essai, d'un peu plus de moitié après de la moutarde brune.35,36,37 Les crucifères sécrètent probablement en plus des substances qui freinent la colonisation.38

Au potager, c'est le plus souvent sans conséquence. Avant une nouvelle plantation d'arbres et d'arbustes, avant du maïs ou avant des cultures très dépendantes comme les agrumes, c'est en revanche un vrai handicap. Si tu choisis ton engrais vert en pensant aux champignons, prends de la phacélie, du trèfle, de la vesce, du seigle ou tout simplement un mélange de graminées, et laisse de côté la moutarde et le radis fourrager, qui ne forment pas de partenariat, ainsi que le sarrasin, qui n'est que faiblement colonisé.39

Pratique

Les mycorhizes au jardin : les questions les plus fréquentes

Les questions qui se posent vraiment au moment de planter, de « est-ce que je dois faire quelque chose ? » à « comment relier deux groupes ? ».

Quand la mycorhize vient-elle toute seule, et quand ne vient-elle pas ?

Cela dépend du système, et la différence est grande.

Mycorhize arbusculaire : déjà là. Chaque prairie et chaque champ en sont pleins, car les graminées et les herbacées sont elles-mêmes partenaires de ces champignons. Un pommier, un noyer ou un sureau que tu plantes dans une prairie est colonisé en quelques semaines à quelques mois. Tu n'as rien à faire.

Ectomycorhize : c'est là que ça se complique. Dans une prairie sans arbres hôtes, il n'y a guère de spores de ces champignons. Un chêne, un hêtre, un noisetier ou un châtaignier en terrain découvert ne trouve d'abord pas grand-chose. Les spores arrivent avec le vent et les animaux, et la colonisation prend des mois, voire des années. Dans un essai avec des semis de chêne sur une friche, tous étaient colonisés jusqu'à huit mètres de la lisière ; à partir d'environ 15 mètres, la colonisation chutait nettement.52

Et il y a un ordre d'arrivée : d'abord les champignons pionniers (laccaires, théléphores, hébélomes). Les colonisateurs tardifs, c'est-à-dire russules, cortinaires et amanites, ont besoin de décennies et d'un peuplement établi.53,54 Tu peux donc très bien avoir pendant dix ans une demi-forêt encore pauvrement équipée côté champignons.

Qu'apporte concrètement le fait de planter côte à côte des espèces du même type ?

Cela épargne justement ce temps d'attente, et c'est tout l'intérêt de planifier un groupe.

Si tu plantes un arbuste ectomycorhizien à côté d'un arbre déjà bien installé du même système, le mycélium existant colonise les nouvelles racines. Cela se fait en une saison, au lieu d'attendre pendant des années des spores apportées par hasard.52,55 Un noisetier planté à côté d'un chêne établi n'a donc rien à voir avec le même noisetier seul dans un coin de prairie.

C'est exactement pour cela qu'il vaut la peine de regrouper les arbres et arbustes d'un même système plutôt que de les disperser sur le terrain.

Les types se croisent-ils ? Se gênent-ils mutuellement ?

Non, ils ne se gênent pas. Les hyphes des deux systèmes vivent côte à côte dans le même sol, chacune sur ses propres racines. Une plantation mélangée n'est pas un désavantage.

Ce qu'il faut oublier, c'est l'idée du grand réseau unique. Beaucoup d'individus fongiques ne mesurent que quelques mètres, les plus grands connus quelques dizaines de mètres ; un terrain est un patchwork de nombreux individus de ce genre, pas un câble continu. La « route » dont parle la page sur les guildes est donc plutôt une chaîne de points de passage qu'une conduite. Plus de détails plus haut.

Comment relier deux groupes entre eux ?

Il existe pour cela une solution élégante : le saule et le peuplier peuvent former les deux types, tout comme l'eucalyptus et l'aulne. Le plus souvent, l'ectomycorhize domine ; l'arbusculaire s'y ajoute surtout chez les jeunes plants et sur les sols humides ou extrêmes. Dans le monde, on connaît un peu moins de 90 genres de plantes à double mycorhize28 ; au jardin, ces quatre-là sont les candidats évidents.

Une rangée d'osiers entre un groupe chêne-noisetier et un groupe fruitier devient ainsi l'élément de liaison, et elle fournit au passage du bois de taille, une source de nectar pour les abeilles en tout début de printemps et du matériau de vannerie. Si tu veux mettre l'idée en pratique sur ton terrain, commence par là.

Dois-je acheter des mycorhizes et inoculer ?

Pour les arbres et arbustes fruitiers, c'est presque toujours de l'argent jeté par les fenêtres : ils ont besoin de champignons arbusculaires, et ceux-ci sont de toute façon présents dans un sol de jardin ou de prairie bien établi.

Cela devient utile pour le chêne, le hêtre, le noisetier et le châtaignier en terrain découvert, précisément là où les champignons adéquats manquent et où la colonisation prendrait sinon des années. Et sur les terrains où la vie du sol fait défaut de manière générale : champ cultivé pendant des années, sol brut après un chantier, terre végétale décapée, réhabilitation de sites.

Dans ce cas, toutefois, une brouette de terre prélevée dans la zone racinaire d'un vieil arbre sain de la même espèce est le plus souvent plus efficace et moins chère que n'importe quel produit : tu récupères exactement les champignons qui vivent dans la région et qui s'accommodent du milieu. Beaucoup de produits du commerce ne contiennent de toute façon que des champignons arbusculaires et sont donc d'emblée inefficaces pour un chêne ou un bouleau.

Ce qui aide sans inoculer : garder le sol couvert, le travailler le moins possible, laisser les racines dans le sol pendant l'hiver et éviter les longues périodes sans plantes. Les champignons vivent des racines vivantes : un sol nu les affame.

Alors pourquoi existe-t-il autant de produits différents, et même des produits spéciaux pour conifères ?

Parce que les deux groupes diffèrent fondamentalement sur un point : leur degré d'exigence.

Les champignons arbusculaires sont des généralistes. Il n'en existe que quelques centaines d'espèces pour environ 200 000 plantes partenaires : ils ne peuvent tout simplement pas se permettre d'être difficiles. Un seul et même champignon colonise le pommier, la tomate, le maïs et la lavande. C'est pourquoi un seul produit universel suffit vraiment ici, et la plupart ne contiennent qu'une poignée d'espèces.

Les champignons ectomycorhiziens sont souvent des spécialistes. Plus de vingt mille espèces, dont beaucoup sont liées à un genre d'arbre, voire à une seule espèce : le bolet rude ne pousse qu'avec le bouleau, le bolet élégant qu'avec le mélèze, la truffe noire qu'avec le chêne et le noisetier.56 Un produit polyvalent ne peut donc pas exister, ne serait-ce qu'en principe ; d'où la répartition entre conifères, feuillus, chêne et ainsi de suite. À cela s'ajoute le milieu : les champignons des conifères sont le plus souvent adaptés aux sols acides, d'autres aux sols calcaires.

Le choix réel est pourtant plus restreint que ne le suggèrent les étiquettes. Car on ne peut vendre que ce qui se multiplie, c'est-à-dire surtout des espèces pionnières, justement les généralistes parmi les spécialistes : pisolithes, sclérodermes, laccaires, rhizopogons, hébélomes. Exactement les champignons qui trouvent de toute façon en premier un jeune arbre. Les colonisateurs tardifs, qui font un vieux peuplement, ne se cultivent pas en sachet.

Et ce que la plupart des gens veulent vraiment n'existe pas. Le cèpe et la girolle ne se cultivent toujours pas de façon rentable (pour la girolle, on y est parvenu une fois en laboratoire, en 1997)57,58 : il n'y a donc aucun produit, quelle que soit la demande. La seule exception est la truffe, mais elle n'est pas vendue en poudre : elle l'est sous forme de jeune arbre déjà mycorhizé et certifié, en pépinière.

Une partie de la diversité relève simplement du marketing. Le marché est très peu réglementé, et les analyses de produits du commerce trouvent régulièrement des écarts entre l'étiquette et le contenu, jusqu'à des emballages sans champignons viables détectables. Dans un contrôle mondial de 28 produits, 84 % n'ont entraîné aucune colonisation dans un sol stérile.59,60,61

Ce que cela signifie en pratique, c'est exactement ce que dit le paragraphe précédent : là où il faut vraiment inoculer, la brouette de terre prélevée dans la zone racinaire d'un vieil arbre sain de la même espèce est la voie la plus fiable. Les bonnes espèces y sont garanties, vivantes et habituées au milieu.

Les arbres exotiques sont-ils plus sensibles aux maladies ?

Le constat est net, la cause ne l'est pas. Une étude menée dans 48 parcs de châteaux tchèques a analysé le sol sous 73 essences exotiques : les pathogènes y représentaient une part deux fois plus grande des espèces fongiques et une part trois fois plus grande de la biomasse fongique que sous les arbres indigènes, et les champignons ectomycorhiziens une part plus petite. Plus une essence poussait depuis longtemps sur place, plus la part de pathogènes diminuait.62

Cela ne dit pas pour autant d'où cela vient. Cela pourrait tenir à un moins bon approvisionnement en champignons partenaires adéquats ; cela peut tout aussi bien tenir aux pathogènes importés en même temps que les plantes. Les deux sont plausibles, aucun n'est prouvé.

Formulé honnêtement, le constat est donc : moins de champignons partenaires, plus de pathogènes, cause inconnue. Il reste utilisable comme règle empirique pour planter, simplement en tant qu'observation et non en tant qu'explication.

Et les champignons comestibles, je peux les prévoir dans mon plan ?

Oui, mais par un autre chemin que l'inoculation décrite plus haut, même s'il s'agit des mêmes groupes de champignons. Pour récolter des truffes, des cèpes ou des girolles, on achète des plants mycorhizés de façon ciblée (un noisetier ou un chêne dont les racines ont été colonisées en pépinière par une espèce de champignon précise), et il faut en plus le sol adéquat, avec surtout un pH élevé pour les truffes. Rien à voir avec une poudre de mycorhizes polyvalente.

Des champignons comme le pleurote ou le shiitake, eux, ne sont pas du tout mycorhiziens, mais décomposeurs : on les cultive sur des troncs ou sur un substrat, indépendamment de tout arbre vivant. C'est pourquoi on en trouve dans le commerce, et pas de cèpes.

Un groupe de cèpes au pied d'un vieux feuillu, dans l'herbe
Les cèpes ne poussent pas par hasard au pied du tronc : ils vivent de cet arbre et lui d'eux. C'est justement pour cela qu'on ne peut pas les cultiver sur de la paille comme un pleurote : sans partenaire vivant, pas de cèpe.

Pour aller plus loin

Ce que cela change pour ton plan de plantation

Trois phrases suffisent au quotidien. Un : un champignon ne colonise que les plantes de son propre système ; planter un arbre forestier au milieu d'arbres fruitiers, c'est le priver de partenaire. Deux : c'est le voisinage qui compte, pas la surface ; place les arbres et arbustes d'un même système de façon que leurs zones racinaires se touchent. Trois : un groupe de plantes ne devrait pas être limité à un seul système, sinon il n'a aucune connexion avec ce qui pousse à côté.

Carte de jardin Permaplans avec le calque Zones racinaires des mycorhizes : cercles racinaires colorés pour chaque arbre ou arbuste (ecto, endo, double système et éricacées) sur la photo aérienne, avec des signes plus qui proposent des plantes pour combler les vides
Voici à quoi cela ressemble dans Permaplans : le calque « Zones racinaires des mycorhizes » colore la zone racinaire estimée de chaque arbre ou arbuste selon son système (bleu ecto, jaune endo, vert les deux, violet les éricacées comme la myrtille et le rhododendron). Là où des surfaces de même couleur se superposent, un champignon commun est probable ; les signes plus proposent des plantes pour combler les vides.

Comment en faire une plantation complète, avec plante d'ancrage, rôles et calendrier, c'est l'objet de la page sœur : Guildes de plantes : ce qui doit pousser ensemble.

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Références

Sources

Les chiffres en exposant dans le texte renvoient ici, et ↩ ramène à l'endroit du texte. Pour les connaissances de manuel, c'est l'ouvrage de référence qui est cité ; là où les spécialistes ne sont pas d'accord (surtout sur le Wood Wide Web), les deux camps sont cités. Les conclusions pour la planification, comme le regroupement des arbres et arbustes, sont nos propres déductions à partir de ces résultats, pas des résultats d'études.

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  59. Salomon, M. J., Demarmels, R., Watts-Williams, S. J., McLaughlin, M. J., Kafle, A., Ketelsen, C., Soupir, A., Bücking, H., Cavagnaro, T. R. & van der Heijden, M. G. A. (2022): Global evaluation of commercial arbuscular mycorrhizal inoculants under greenhouse and field conditions. Applied Soil Ecology 169: 104225. doi:10.1016/j.apsoil.2021.104225 ↩
  60. Faye, A., Dalpé, Y., Ndung’u-Magiroi, K., Jefwa, J., Ndoye, I., Diouf, M. & Lesueur, D. (2013): Evaluation of commercial arbuscular mycorrhizal inoculants. Canadian Journal of Plant Science 93: 1201–1208. doi:10.4141/cjps2013-326 ↩
  61. Koziol, L., Lubin, T. & Bever, J. D. (2024): An assessment of twenty-three mycorrhizal inoculants reveals limited viability of AM fungi, pathogen contamination, and negative microbial effect on crop growth for commercial products. Applied Soil Ecology 202: 105559. doi:10.1016/j.apsoil.2024.105559 ↩
  62. Vlk, L., Odriozola, I., Pergl, J., Větrovský, T., Kvasničková, J., Krüger, C., Petružálková, M., Baldrian, P., Vojík, M., Sádlo, J., Petřík, P., Pyšek, P. & Kohout, P. (2026): From pathogens to partners: temporal and biogeographical patterns in fungal associations of alien trees. New Phytologist 250: 3381–3395. doi:10.1111/nph.71094 ↩

Sources vérifiées pour la dernière fois : octobre 2026. Tu as repéré une erreur ? Écris-nous.

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